| Titre | Distribution and diversity of Verrucomicrobia methanotrophs in geothermal and acidic environments |
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| Auteur | Sharp, C E; Smirnova, A V; Graham, J M; Stott, M B; Khadka, R; Moore, T R; Grasby, S E ; Strack, M; Dunfield, P F |
| Source | Environmental Microbiology vol. 16, issue 6, 2014 p. 1867-1878, https://doi.org/10.1111/1462-2920.12454 |
| Image |  |
| Année | 2014 |
| Séries alt. | Secteur des sciences de la Terre, Contribution externe 20130412 |
| Éditeur | Wiley-Blackwell |
| Document | publication en série |
| Lang. | anglais |
| DOI | https://doi.org/10.1111/1462-2920.12454 |
| Media | papier; numérique; en ligne |
| Formats | pdf; html |
| Sujets | méthane; géochimie des fluides géothermiques; bactéries |
| Illustrations | graphiques; diagrammes; tableaux |
| Programme | Géoscience Énergie |
| Diffusé | 2014 04 18 |
| Résumé | (disponible en anglais seulement)
Recently, methanotrophic members of the phylum Verrucomicrobia have been described, but little is known about their distribution in nature. We surveyed
methanotrophic bacteria in geothermal springs and acidic wetlands via pyrosequencing of 16S rRNA gene amplicons. Putative methanotrophic Verrucomicrobia were found in samples covering a broad temperature range (22.5-81.6°C), but only in acidic
conditions (pH 1.8-5.0) and only in geothermal environments, not in acidic bogs or fens. Phylogenetically, three 16S rRNA gene sequence clusters of putative methanotrophic Verrucomicrobia were observed. Those detected in high-temperature geothermal
samples (44.1-81.6°C) grouped with known thermoacidiphilic 'Methylacidiphilum' isolates. A second group dominated in moderate-temperature geothermal samples (22.5-40.1°C) and a representative mesophilic methanotroph from this group was isolated
(strain LP2A). Genome sequencing verified that strain LP2A possessed particulate methane monooxygenase, but its 16S rRNA gene sequence identity to 'Methylacidiphilum infernorum' strain V4 was only 90.6%. A third group clustered distantly with known
methanotrophic Verrucomicrobia. Using pmoA-gene targeted quantitative polymerase chain reaction, two geothermal soil profiles showed a dominance of LP2A-like pmoA sequences in the cooler surface layers and 'Methylacidiphilum'-like pmoA sequences in
deeper, hotter layers. Based on these results, there appears to be a thermophilic group and a mesophilic group of methanotrophic Verrucomicrobia. However, both were detected only in acidic geothermal environments. |
| Sommaire | (Résumé en langage clair et simple, non publié)
Une recherche coopérative a été menée sur la nature et la répartition des bactéries méthanotrophes (méthanoxydantes) et sur les facteurs
environnementaux qui influent sur ces bactéries. Les résultats aident à comprendre l'utilisation potentielle de ces bactéries pour remédier aux émissions fugaces dans les projets d'exploitation du gaz de schiste ou dans d'autres sites industriels et
pour réduire les répercussions sur les gaz à effet de serre causées par la fuite de méthane dans l'atmosphère lorsque les gaz sont trop diffus pour être directement captés. |
| GEOSCAN ID | 293518 |
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